El Departamento de Coordinación Intersectorial es el encargado de liderar el diseño del trabajo intersectorial en prevención del delito, mediante la generación de diagnósticos y estrategias que integren a actores tanto público como privados. Además, debe implementar y coordinar las acciones en el marco de los programas de la Subsecretaría y el Plan Nacional de Seguridad Pública que requieran articulación con otras instituciones públicas o privadas, como así también el seguimiento a la agenda de trabajo intersectorial de la SPD y coordinar los acuerdos de colaboración en materia de prevención del delito con otras organizaciones e instituciones, públicas o privadas.

El orden interno del  Departamento  se rige según la Resolución exenta N°1420 del 8 de Septiembre de 2022.